Жінки після лікування методом ЕКЗ мають більш високий ризик розвитку ускладнень вагітності: токсикозів, мимовільних абортів, передчасних пологів та інших ускладнень під час пологів. Ці ускладнення частіше виникають при багатоплідних вагітності, ніж при вагітності одним плодом.
