Він контролюється центральною нервовою системою, тобто головним мозком. Тому наш психоемоційний стан може проводити роботу кишечника. При стресі може відбуватися прискорення моторики кишечника, що призводить до діареї. Вважається, що в цьому є зв'язок із давніми інстинктами.