Дуже часто аптечну ромашку плутають з пупавкою польовою (Anthemis arvensis). Перша відмінність між цими двома рослинами – форма квітколожа. У ромашки аптечної воно конічне, а у пупавки ледь опукле. Якщо його розрізати, то у ромашки воно виявиться порожнім усередині, тоді як у пупавки щільне.
