Проходження протонів водню через АТФ-синтазу супроводжується синтезом молекул АТФ з АДФ та фосфату або фотофосфорилування, на відміну від окисного фосфорилювання. На цьому світлова фаза фотосинтезу закінчується, а НАДФН+ та АТФ переходять у темнову фазу.
