Меліса лимонна застосовується у вигляді відварів та настоїв, входить до складу трав'яного чаю, її використовують як інгредієнт при приготуванні салатів та супів. У сушеному вигляді рослина використовується як прянощі. Лимонна меліса використовується для ароматизації деяких алкогольних напоїв.
