Найхолодніший місяць – січень. Температура повітря залежить від висоти над рівнем моря: на вершинах гір та схилах вона може становити –15, –20 °C, тоді як у котлованах та ущелинах буде –40, –50 °C. Найхолодніші місця — плато Укок, Курайська улоговина та Чуйський степ.