Свіжі каперси краще приготувати відразу. На полиці для овочів та фруктів у холодильнику вони зберігаються пару днів. Консервовані каперси мають термін зберігання 6 місяців. Після того, як банку відкрили, її потрібно поставити в холодильник, де в розсолі каперси зберігатиметься близько двох місяців.
