Тіло гідри складається з двох шарів: зовнішнього – ектодерми та внутрішнього – ентодерми, ротовий отвір веде безпосередньо в ентодермальну гастроваскулярну порожнину. Зовнішні клітини тіла диференційовані на епітеліальні, епітеліально-м'язові, інтерстиціальні (проміжні), жалобні та нервові.
