Фітохром, на відміну від хлорофілу, є не тільки в листі, а й у насінні. Участь фітохрому в процесі проростання насіння для деяких видів рослин така: червоне світло стимулює процеси проростання насіння, а далеке червоне – пригнічує. Можливо, саме тому насіння і проростає вночі.
