Вживання соку лимона в чистому вигляді може призвести до руйнування зубної емалі, тому бажано розбавляти його водою і після вживання полоскати рот. Велика кількість кислот у соку може мати подразнюючу дію на слизову оболонку шлунка, особливо якщо є запальні захворювання ШКТ.
