Для швидкої стерилізації інструментів застосовують 0,5% водно-спиртовий розчин хлоргексидину протягом 5 хв. Для повільної стерилізації інструментів застосовують водний розчин 0,02% протягом 30 хв. 0,1% водним розчином можна також користуватися для загальної дезінфекції приміщень, санітарного обладнання тощо.
