У ствол завжди включають довгастий мозок, варолієвий міст, а також середній мозок. Часто в нього включають мозок, іноді – проміжний мозок.
До ствола головного мозку відносяться: довгастий мозок, міст та середній мозок. У різних ділянках стволовий частини головного мозку зосереджено центри життєво важливих рефлексів: дихання, травлення, обміну речовин, ковтання, кровообігу тощо.
Стовбур мозку розташований внизу під півкулями і попереду мозочка. Він з'єднує мозок з хребтом та регулює автоматичні функції – дихання, травлення, серцебиття та кров'яний тиск.
Головний мозок вищих хребетних організмів складається з низки структур: кори великих півкуль, базальних гангліїв, таламуса, мозочка, стовбура мозку. Ці структури з'єднані між собою нервовими волокнами (провідні шляхи).