Забарвлення квіток меліси блідо-лілова або біла з синьової, а у котовника вони можуть бути рожевими. На нижній губі у меліси відсутні плямистий малюнок, характерний для котовника. Час цвітіння у рослин приблизно однаковий, але котівник, що перезимував, зацвітає трохи раніше.
